MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015179	CGGAC	2	10	92	101	20 %	0 %	40 %	40 %	325113278
2	NC_015179	G	6	6	136	141	0 %	0 %	100 %	0 %	325113278
3	NC_015179	GGC	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
4	NC_015179	GGC	3	9	168	176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
5	NC_015179	GCC	2	6	192	197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113278
6	NC_015179	GTG	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113278
7	NC_015179	GGT	2	6	270	275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113278
8	NC_015179	CTG	2	6	284	289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113278
9	NC_015179	CAG	2	6	295	300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113278
10	NC_015179	GGATCT	2	12	303	314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325113278
11	NC_015179	TGG	2	6	365	370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113278
12	NC_015179	CGGC	2	8	402	409	0 %	0 %	50 %	50 %	325113278
13	NC_015179	CGC	2	6	455	460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113278
14	NC_015179	CGA	2	6	474	479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113278
15	NC_015179	CGG	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
16	NC_015179	CGG	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
17	NC_015179	AGGT	2	8	593	600	25 %	25 %	50 %	0 %	325113278
18	NC_015179	GGA	2	6	630	635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113278
19	NC_015179	GCG	2	6	639	644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
20	NC_015179	CGCGG	2	10	753	762	0 %	0 %	60 %	40 %	325113278
21	NC_015179	GC	3	6	776	781	0 %	0 %	50 %	50 %	325113278
22	NC_015179	CCA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113278
23	NC_015179	AGT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113278
24	NC_015179	GAC	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113278
25	NC_015179	CGGT	2	8	945	952	0 %	25 %	50 %	25 %	325113278
26	NC_015179	GAT	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113278
27	NC_015179	TGC	2	6	1010	1015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113278
28	NC_015179	CGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113278
29	NC_015179	GCT	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113278
30	NC_015179	GTC	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113278
31	NC_015179	GGCCT	2	10	1083	1092	0 %	20 %	40 %	40 %	325113278
32	NC_015179	GGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
33	NC_015179	GGC	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
34	NC_015179	CGG	2	6	1245	1250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113278
35	NC_015179	GCT	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113279
36	NC_015179	CGC	2	6	1448	1453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113279
37	NC_015179	TCAA	2	8	1599	1606	50 %	25 %	0 %	25 %	325113279
38	NC_015179	TGC	2	6	1610	1615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113279
39	NC_015179	GA	3	6	1952	1957	50 %	0 %	50 %	0 %	325113280
40	NC_015179	GAG	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113280
41	NC_015179	GTG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113281
42	NC_015179	CGC	2	6	2672	2677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113281
43	NC_015179	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113281
44	NC_015179	CGG	2	6	2706	2711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
45	NC_015179	GCG	2	6	2773	2778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
46	NC_015179	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113281
47	NC_015179	CGC	2	6	2801	2806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113281
48	NC_015179	GTCC	2	8	2844	2851	0 %	25 %	25 %	50 %	325113281
49	NC_015179	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113281
50	NC_015179	GAT	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113281
51	NC_015179	ACGG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	50 %	25 %	325113281
52	NC_015179	ATCA	2	8	3015	3022	50 %	25 %	0 %	25 %	325113281
53	NC_015179	TGC	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113281
54	NC_015179	TCG	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113281
55	NC_015179	GGA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113281
56	NC_015179	GTTC	2	8	3212	3219	0 %	50 %	25 %	25 %	325113281
57	NC_015179	GAC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113281
58	NC_015179	GGC	3	9	3296	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
59	NC_015179	GGC	2	6	3344	3349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
60	NC_015179	GAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113281
61	NC_015179	GCG	2	6	3462	3467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
62	NC_015179	TCGA	2	8	3523	3530	25 %	25 %	25 %	25 %	325113281
63	NC_015179	ACG	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113281
64	NC_015179	GCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113281
65	NC_015179	CG	3	6	3803	3808	0 %	0 %	50 %	50 %	325113282
66	NC_015179	GGGC	2	8	3898	3905	0 %	0 %	75 %	25 %	325113282
67	NC_015179	AGC	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113282
68	NC_015179	CGG	2	6	3973	3978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113282
69	NC_015179	AGCCGC	2	12	3982	3993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325113282
70	NC_015179	CCG	2	6	4030	4035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113282
71	NC_015179	CCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113282
72	NC_015179	CGG	2	6	4132	4137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113282
73	NC_015179	GGCGA	2	10	4142	4151	20 %	0 %	60 %	20 %	325113282
74	NC_015179	GGC	3	9	4169	4177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113282
75	NC_015179	GGT	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113282
76	NC_015179	CGG	2	6	4210	4215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113282
77	NC_015179	GCC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113282
78	NC_015179	C	6	6	4355	4360	0 %	0 %	0 %	100 %	325113283
79	NC_015179	GAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113283
80	NC_015179	CTG	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113283
81	NC_015179	CG	3	6	4495	4500	0 %	0 %	50 %	50 %	325113283
82	NC_015179	TGT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113283
83	NC_015179	GCGGT	2	10	4535	4544	0 %	20 %	60 %	20 %	325113283
84	NC_015179	CG	3	6	4570	4575	0 %	0 %	50 %	50 %	325113283
85	NC_015179	CATGAC	2	12	4732	4743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325113284
86	NC_015179	CCGA	2	8	4745	4752	25 %	0 %	25 %	50 %	325113284
87	NC_015179	AGC	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113284
88	NC_015179	GCA	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113284
89	NC_015179	CGC	2	6	4915	4920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113284
90	NC_015179	GCG	2	6	4963	4968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113284
91	NC_015179	GGCC	2	8	5055	5062	0 %	0 %	50 %	50 %	325113284
92	NC_015179	GAT	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113284
93	NC_015179	ACC	3	9	5207	5215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113284
94	NC_015179	AAC	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325113284
95	NC_015179	GTG	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113284
96	NC_015179	ATCAGG	2	12	5348	5359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113284
97	NC_015179	CCCG	2	8	5377	5384	0 %	0 %	25 %	75 %	325113284
98	NC_015179	GCCGGT	2	12	5395	5406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113284
99	NC_015179	CAG	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113284
100	NC_015179	GGC	2	6	5551	5556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113284
101	NC_015179	TCA	2	6	5622	5627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113284
102	NC_015179	GATC	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	325113284
103	NC_015179	ATC	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113284
104	NC_015179	CGG	2	6	5717	5722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113284
105	NC_015179	ATC	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113284
106	NC_015179	TGA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113284
107	NC_015179	CAG	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113284
108	NC_015179	GACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	25 %	50 %	325113284
109	NC_015179	CGG	2	6	6039	6044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113284
110	NC_015179	GGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113285
111	NC_015179	TTG	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113285
112	NC_015179	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113285
113	NC_015179	TCG	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113285
114	NC_015179	AGC	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113285
115	NC_015179	GGC	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113285
116	NC_015179	GGA	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113285
117	NC_015179	GCG	2	6	6902	6907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113286
118	NC_015179	CAA	2	6	6913	6918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325113286
119	NC_015179	GCC	2	6	6985	6990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113286
120	NC_015179	TGC	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113286
121	NC_015179	TCA	2	6	7068	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113286
122	NC_015179	GCCG	2	8	7080	7087	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
123	NC_015179	CGA	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113286
124	NC_015179	CGGC	3	12	7193	7204	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
125	NC_015179	GTT	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113286
126	NC_015179	GC	3	6	7230	7235	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
127	NC_015179	CGC	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113286
128	NC_015179	TCA	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113286
129	NC_015179	GAC	2	6	7318	7323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113286
130	NC_015179	CATC	2	8	7437	7444	25 %	25 %	0 %	50 %	325113286
131	NC_015179	CCA	2	6	7494	7499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113286
132	NC_015179	ATGG	2	8	8157	8164	25 %	25 %	50 %	0 %	325113287
133	NC_015179	CGA	2	6	8171	8176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113287
134	NC_015179	TGCG	2	8	8184	8191	0 %	25 %	50 %	25 %	325113287
135	NC_015179	GCG	2	6	8224	8229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113287
136	NC_015179	TCGA	2	8	8257	8264	25 %	25 %	25 %	25 %	325113287
137	NC_015179	GGC	3	9	8333	8341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113287
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139	NC_015179	CCGA	2	8	8424	8431	25 %	0 %	25 %	50 %	325113287
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142	NC_015179	GC	3	6	8520	8525	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
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149	NC_015179	GGCT	2	8	8617	8624	0 %	25 %	50 %	25 %	325113287
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254	NC_015179	GCA	3	9	13003	13011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113291
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258	NC_015179	C	7	7	13097	13103	0 %	0 %	0 %	100 %	325113291
259	NC_015179	ACC	2	6	13119	13124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113291
260	NC_015179	ATC	2	6	13170	13175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113291
261	NC_015179	GGC	3	9	13205	13213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113291
262	NC_015179	CGA	2	6	13222	13227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113291
263	NC_015179	TCG	2	6	13249	13254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113291
264	NC_015179	CGA	2	6	13264	13269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113291
265	NC_015179	CAC	2	6	13307	13312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113291
266	NC_015179	GAC	2	6	13352	13357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113291
267	NC_015179	CAT	2	6	13367	13372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113291
268	NC_015179	GCG	2	6	13438	13443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113291
269	NC_015179	CG	3	6	13464	13469	0 %	0 %	50 %	50 %	325113291
270	NC_015179	GAA	2	6	13493	13498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113291
271	NC_015179	GGC	2	6	13552	13557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113291
272	NC_015179	ATTT	2	8	13596	13603	25 %	75 %	0 %	0 %	325113291
273	NC_015179	GGCG	2	8	13612	13619	0 %	0 %	75 %	25 %	325113292
274	NC_015179	CG	3	6	13618	13623	0 %	0 %	50 %	50 %	325113292
275	NC_015179	TCA	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113292
276	NC_015179	GCGA	2	8	13698	13705	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
277	NC_015179	CGGG	2	8	13712	13719	0 %	0 %	75 %	25 %	325113292
278	NC_015179	AGC	2	6	13725	13730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113292
279	NC_015179	GAT	2	6	13745	13750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113292
280	NC_015179	CGG	2	6	13769	13774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113292
281	NC_015179	GATGCC	2	12	13778	13789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113292
282	NC_015179	TGA	2	6	13813	13818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113292
283	NC_015179	CAT	2	6	13829	13834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113292
284	NC_015179	CCG	2	6	13883	13888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
285	NC_015179	CGAG	2	8	13912	13919	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
286	NC_015179	CGC	2	6	13925	13930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
287	NC_015179	GCA	2	6	13948	13953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113292
288	NC_015179	GC	3	6	13976	13981	0 %	0 %	50 %	50 %	325113292
289	NC_015179	GAT	2	6	14006	14011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113292
290	NC_015179	TGA	3	9	14041	14049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113292
291	NC_015179	TGA	2	6	14074	14079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113292
292	NC_015179	AGAT	2	8	14106	14113	50 %	25 %	25 %	0 %	325113292
293	NC_015179	ATA	2	6	14125	14130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325113292
294	NC_015179	CGC	2	6	14180	14185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
295	NC_015179	GAG	2	6	14192	14197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113292
296	NC_015179	CGAGG	2	10	14198	14207	20 %	0 %	60 %	20 %	325113292
297	NC_015179	CAG	2	6	14240	14245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113292
298	NC_015179	CCCG	2	8	14251	14258	0 %	0 %	25 %	75 %	325113292
299	NC_015179	AGC	2	6	14265	14270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113292
300	NC_015179	CGC	2	6	14273	14278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
301	NC_015179	TCGC	2	8	14361	14368	0 %	25 %	25 %	50 %	325113292
302	NC_015179	GCC	2	6	14411	14416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
303	NC_015179	GCC	2	6	14469	14474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113292
304	NC_015179	AGGC	2	8	14475	14482	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
305	NC_015179	AGC	2	6	14484	14489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113292
306	NC_015179	ACC	2	6	14490	14495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113292
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312	NC_015179	CTT	2	6	14824	14829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325113293
313	NC_015179	CCGCCA	2	12	14853	14864	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325113293
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360	NC_015179	GCG	2	6	17441	17446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113296
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367	NC_015179	CCAGG	2	10	17841	17850	20 %	0 %	40 %	40 %	325113297
368	NC_015179	GCA	2	6	17864	17869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113297
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372	NC_015179	CGG	2	6	18222	18227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113298
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381	NC_015179	GGC	2	6	18752	18757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113299
382	NC_015179	CGG	2	6	18799	18804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113299
383	NC_015179	CG	3	6	18854	18859	0 %	0 %	50 %	50 %	325113299
384	NC_015179	TTG	2	6	18864	18869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113299
385	NC_015179	CCAT	2	8	18921	18928	25 %	25 %	0 %	50 %	325113299
386	NC_015179	GCG	2	6	18972	18977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113299
387	NC_015179	GCG	2	6	19026	19031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113299
388	NC_015179	TGGA	2	8	19035	19042	25 %	25 %	50 %	0 %	325113299
389	NC_015179	TGGCGG	2	12	19084	19095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325113299
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496	NC_015179	GGCG	2	8	23303	23310	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
497	NC_015179	GGC	2	6	23326	23331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113302
498	NC_015179	GC	4	8	23363	23370	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
499	NC_015179	TGGG	2	8	23440	23447	0 %	25 %	75 %	0 %	325113302
500	NC_015179	CAG	2	6	23570	23575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113302

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